После того, как канал был введен в эксплуатацию , рыбаки обнаружили, что устье новой гавани с обоими пирсами является безопасным причалом. Там была оживленная рыболовная торговля, все больше и больше рыбацких лодок и торговцев мешали судоходству. В 1896 году в Эймёйдене появился собственный рыболовный порт, а два года спустя был открыт Рейксвисафслаг. Ранее, в 1883 году, ветка железной дороги от Харлема до Уитгеста, которая была построена в 1867 году, была построена с целью рыболовства за пределами Сантпоорт-Ноорда. В 1983 году производство этой так называемой «лески» было прекращено. В 1914 году рыболовный флот Эймёйдена состоял из 155 траулеров, что составляло треть всего голландского рыболовного флота. Во время Первой мировой войны большая часть флота была потеряна в результате объявленной немцами подводной войны. Вторая мировая война нанесла Эймёйдену огромный ущерб. Большая часть траулеров была реквизирована немцами, а значительная часть Эймёйдена и Вейк-ан-Зее была снесена, чтобы освободить место для бункеров у Атлантического вала, который должен был остановить вторжение союзников. После освобождения рыбная промышленность не восстановилась, но, к счастью, появились другие формы занятости.