Чтобы создать Ваттовое море, нам нужно вернуться примерно на 45 000 лет назад, к последнему ледниковому периоду. Вся вода в Северном море оказалась в ловушке крупных ледников, поэтому уровень моря был намного ниже, чем сейчас. Тогдашняя береговая линия находилась в десятках километров к северу от нынешних островов Вадден. В конце ледникового периода ледники начали таять, и уровень моря поднялся. Около 9000 лет назад между Францией и Англией образовался Ла-Манш, и с тех пор два больших паводковых течения текли в Северное море два раза в день , одно с юга, а другое с севера.

6000 лет назад уровень моря был всего на 5 метров ниже нынешнего. Силы двух приливных течений с юга и севера создали своего рода бульдозерный эффект на песках в Северном море . Образовался длинный ряд песчаных отмелей, так называемая пляжная гряда. Со временем пляжная гряда в разных местах прорывалась, а торфяная зона за ней заполнилась соленой водой. Возникла разветвленная сеть солончаков и болот, больших и малых островов. Сильный штормовой нагон в 1362 году создал Доллард и Зейдерзее. Даже после 1362 года в этом районе многое изменилось; острова стали больше или меньше, или даже полностью исчезли в волнах. Зейдерзее и Лауэрзее были закрыты и освоены солончаки на побережье, так называемые мелиорации земель.