Após este período, Enkhuizen teve de lidar com os navios corsários de Oostende e Dunquerque e o boicote aos navios holandeses num contexto internacional, na sequência do ‘Acto de Navegação’ do ditador inglês Cromwell. A praga causou mais de 2.600 vítimas em 1636.
Somado a isso foi a eclosão da Primeira Guerra Mundial em 1914 e a crescente posição de Amsterdã , às custas das cidades de Noorderkwartier. Enkhuizen perdeu muito capital para restaurar as consequências do assoreamento da foz do porto. Várias guerras diminuíram drasticamente a população, assim como a frota de arenque. Durante o último quarto do século passado, a posição de Enkhuizen se fortaleceu novamente, em parte devido à nova conexão ferroviária com Amsterdãe a intensificação da agricultura e horticultura na Frísia Ocidental. Além do cultivo das sementes usuais, as pessoas estão cada vez mais engajadas no cultivo de sementes de flores. O cultivo de batatas e vegetais aumentou continuamente e a cultura de bulbos de flores ofereceu boas perspectivas. O fechamento do Zuiderzee em 1932 proporcionou uma vida razoável para os pescadores de enguia e zander. A população aumentou rapidamente após a Segunda Guerra Mundial e uma era de recuperação começou. Várias empresas grandes e pequenas se desenvolveram. As empresas de sementes atualmente localizadas em Enkhuizen ocupam uma posição de liderança em todo o mundo. Uma importante indústria de plásticos também está localizada no município. Na área turística, Enkhuizen oferece um belo centro histórico da cidade, o Museu Zuiderzee e as marinas,