O Afsluitdijk é principalmente uma defesa contra enchentes, mas tem várias funções; de gestão de risco de inundação, abastecimento de água doce, ecologia, tráfego e transporte por estrada e água até história cultural e recreação. Para proteger a área posterior contra inundações, o dique deve ser alto e forte o suficiente para resistir ao mar nas condições mais extremas. Os dois complexos de eclusas no Afsluitdijk, o Stevinsluizen em Den Oever e as eclusas Lorentz em Kornwerderzand, descarregam o excesso de água no Mar de Wadden . Essa água vem do IJssel , um braço do Reno que se origina na Suíça e no IJsselmeer.flui para dentro. Estas eclusas são utilizadas por embarcações profissionais e recreativas para ir e vir do Mar de Wadden e são muito importantes devido à acessibilidade do Norte, Centro e Leste dos Países Baixos.

O IJsselmeer é um importante suprimento de água doce para a Holanda. Nos períodos de seca, por exemplo, a água para a agricultura pode ser canalizada para as zonas envolventes, a água é utilizada para beber e tem funções ecológicas. É importante para muitas espécies de pássaros e peixes. O Afsluitdijk acabou sendo um obstáculo inexpugnável para os peixes migrarem da água doce para a salgada e vice-versa. É por isso que uma passagem para peixes foi construída no lado oeste da eclusa em Den Oever. Além disso, um rio de migração de peixes de 4 quilômetros de comprimento está sendo construído perto de Kornwerderzand, que cruza o Afsluitdijk. Este rio garante que o Mar de Wadden e o IJsselmeer estejam conectados novamente e que os peixes possam nadar facilmente para a frente e para trás.