Circa 5.000 anni fa furono create le pareti della spiaggia che formano gran parte della costa del Mare del Nord nell’Olanda settentrionale. Questo muro di spiaggia era chiuso tra Camperduin e Texel, ma era molto stretto. Dietro questo muro di spiaggia c’era una zona di torba che era già coltivata nell’alto medioevo. In parte a seguito di queste bonifiche, il mare ha sfondato lo stretto costone della spiaggia in tre punti tra gli anni 1000 e 1300 e ha distrutto gran parte della torba retrostante, creando un’area di wadden con le insenature di marea di Marsdiep, Heersdiep e Zijpe da nord a sud. In mezzo c’erano due tratti rimanenti di costa della spiaggia: le isole di Callantsoog (‘t Oghe) e Huijsduinen. Nel XV e XVI secolo, le bocche di marea Zijpe e Heersdiep si riempirono di nuovo lentamente e il Marsdiep divenne più ampio e profondo. Dalla metà del XVI secolo furono fatti diversi tentativi infruttuosi di prosciugare lo Zijpepolder. Si pensava che le prime dighe potessero essere realizzate senza mulini a causa della posizione relativamente alta del polder, ma dal 1561 si dovette utilizzare mulini per mantenere asciutta l’area. I dieci mulini furono risparmiati dalla forte alluvione del 1570, ma le dighe si indebolirono e il polder fu nuovamente esposto alle maree. I mulini furono demoliti e nel 1597 l’ultimo terrapieno con una diga di sabbia a Hondsbossche e Pettemer Zeewering seguì e lo Zijpepolder divenne un dato di fatto. Allo stesso tempo, anche l’Hazepolder molto più piccolo immediatamente a sud di Petten è stato impoldato. I numerosi mulini che tenevano all’asciutto lo Zijpe furono dismessi tra il 1950 e il 1966. Nel 1877 la diga di sabbia fu trasformata in una diga molto più robusta, ricoperta di blocchi di basalto: l’Hondsbossche Zeewering. Grazie al successo dello Zijpepolder, è stato più facile trovare investitori per progetti simili e così successivamente sono stati bonificati Beemster , Purmer, Wormer, Heerhugowaard e Schermer . Sulla forma allungata del polder è stata innestata la struttura principale per la suddivisione dello Zijpepolder, conferendogli la sua caratteristica piega. Il polder è stato tagliato longitudinalmente da tre assi (nastri) lungo i quali sono state costruite le fattorie, da ovest a est il Belkmerweg, il Ruigeweg e il Grote Sloot. La posizione del Grote Sloot è stata in gran parte determinata dalla presenza del vecchio canale del fiume Sint Maartenszwin. I blocchi allungati tra i nastri sono stati divisi in lotti regolari e allungati. In alcuni punti il polder era attraversato da un bivio e agli incroci di nastri di sviluppo e crocevia sono sorti nuclei di strade. La serie di nuclei su una strada trasversale apparteneva insieme, come Sint Maartenszee, Sint Maartensvlotbrug, Sint Maartensbrug e Sint Maarten. Allo stesso tempo, i nomi dei luoghi lungo un asse lungo hanno ottenuto di nuovo la stessa uscita, come Burgerbrug, Sint Maartensbrug e Schagerbrug. Grandi case coloniche sorgevano sul Grote Sloot; case coloniche tradizionali con annessa casa anteriore, paragonabili ad alcune grandi case padronali nelle successiveBeemster . Mercanti di Amsterdam , reggenti di Alkmaar e ricchi di Medemblik , Hoorn ed Enkhuizen costruirono anche piantagioni e tenute di campagna, come Wildrijk e Ananas.

Il Noordhollandsch Kanaal fu scavato nel polder intorno al 1824 . Questo canale formava il collegamento da Amsterdam al Mare del Nord e in parte seguiva le linee del polder. Nella parte settentrionale, il canale taglia diagonalmente i lotti in direzione di Den Helder. I ponti delle zattere collegavano entrambi i lati del canale.