Per la creazione del mare di Wadden dobbiamo tornare indietro di circa 45.000 anni, fino all’ultima era glaciale. Tutta l’acqua nel Mare del Nord era intrappolata in grandi ghiacciai, quindi il livello del mare era molto più basso di quanto non sia ora. La costa allora si trovava a decine di chilometri a nord delle attuali Isole Wadden. Alla fine dell’era glaciale, i ghiacciai iniziarono a sciogliersi e il livello del mare si innalzò. Circa 9.000 anni fa il Canale si è formato tra la Francia e l’Inghilterra e da allora due grandi correnti di piena sono sfociate nel Mare del Nord due volte al giorno , una da sud e una da nord.

6.000 anni fa, il livello del mare era di soli 5 metri sotto il livello attuale. Le forze delle due correnti di marea da sud e da nord hanno creato una sorta di effetto bulldozer sulla sabbia del Mare del Nord . Si formò una lunga fila di banchi di sabbia, il cosiddetto crinale della spiaggia. Nel corso del tempo, il costone della spiaggia si è infranto in vari punti e l’area torba dietro di essa è stata riempita di acqua salata. Sorse una vasta rete di saline e paludi e isole grandi e piccole. Una forte tempesta nel 1362 creò Dollard e gli Zuiderzee. Anche dopo il 1362, molto cambiò nella zona; le isole diventavano più grandi o più piccole, o addirittura scomparivano completamente tra le onde. Lo Zuiderzee e il Lauwerszeefurono chiuse e bonificate le zone di palude salmastra sulla costa, le cosiddette bonifiche.