L’Afsluitdijk è principalmente una difesa dalle inondazioni, ma ha varie funzioni; dalla sicurezza contro le inondazioni, l’approvvigionamento di acqua dolce, l’ecologia, il traffico e il trasporto su strada e sull’acqua alla storia culturale e alle attività ricreative. Per proteggere l’area retrostante dalle inondazioni, la diga deve essere alta e abbastanza forte da resistere al mare nelle condizioni più estreme. I due complessi di chiuse nell’Afsluitdijk, lo Stevinsluizen a Den Oever e le chiuse di Lorentz a Kornwerderzand scaricano l’acqua in eccesso nel mare di Wadden . Quell’acqua proviene dall’IJssel , un ramo del Reno che ha origine in Svizzera e dall’IJsselmeer.scorre dentro. Queste chiuse sono utilizzate da imbarcazioni professionali e da diporto per raggiungere e dal mare di Wadden e sono molto importanti per l’accessibilità dei Paesi Bassi settentrionali, centrali e orientali.

L’ IJsselmeer è un’importante fonte di acqua dolce per i Paesi Bassi. Nei periodi di siccità, ad esempio, l’acqua per l’agricoltura può essere convogliata nelle aree circostanti, l’acqua è utilizzata come acqua potabile e ha funzioni ecologiche. È importante per molte specie di uccelli e pesci. L’Afsluitdijk si è rivelato un ostacolo inespugnabile per i pesci che migrano dall’acqua dolce a quella salata e viceversa. Ecco perché è stato costruito un passaggio per i pesci sul lato ovest della chiusa a Den Oever. Inoltre, vicino a Kornwerderzand, che attraversa l’Afsluitdijk, è in costruzione un fiume di migrazione dei pesci lungo 4 chilometri. Questo fiume assicura che il Waddenzee e l’ IJsselmeer siano nuovamente collegati e che i pesci possano nuotare facilmente avanti e indietro.