Monnickendam a vu le jour là où une rivière de tourbe se jette dans «Het Almere», la douce mer intérieure qui était là jusqu’au 12ème siècle avant de devenir le Zuiderzee. Le nom vient des moines frisons qui se sont installés dans cette région. Monnickendam a été mentionné pour la première fois dans un document écrit en 1288 et a obtenu des droits de ville en 1356, le signal de départ pour une croissance future. La ville a été agrandie et fortifiée. De l’église qui a été construite à l’époque, il ne reste plus que la tour, appelée Speeltoren. Après 1575, commence une période de grande prospérité, à laquelle de nombreux édifices monumentaux rappellent encore. De grands navires de mer pourraient faire escale au port, permettant aux marchands de commercer avec la région de la mer Baltique. Monnickendam, comme Edam et Purmerend, appartenait aux soi-disant villes votantes de la province de Hollande, ce qui signifiait que la ville du 16, Les XVIIe et XVIIIe siècles ont exercé une influence au niveau régional (et indirectement au niveau national). Les 18e et 19e siècles ont été des siècles de stagnation. Les entreprises de transformation du poisson et la construction navale sont restées importantes et, au XXe siècle, les sports nautiques ont été ajoutés. Monnickendam a toujours été une municipalité indépendante, jusqu’à ce qu’elle fasse partie de la municipalité de Waterland en 1991.