Après cette période, Enkhuizen a été confronté à des navires corsaires d’Ostende et de Dunkerque et au boycott des navires néerlandais dans un contexte international, à la suite de «l’Acte de navigation» du dictateur anglais Cromwell. La peste a fait plus de 2600 victimes en 1636.
A cela s’ajoute le déclenchement de la Première Guerre mondiale en 1914 et la position croissante d’ Amsterdam , aux dépens des villes du Noorderkwartier. Enkhuizen a perdu beaucoup de capital à cause de la restauration des conséquences de l’envasement de l’embouchure du port. Diverses guerres ont entraîné un déclin spectaculaire de la population, tout comme la flotte de harengs. Au cours du dernier quart du siècle dernier, la position d’Enkhuizen s’est à nouveau renforcée, en partie grâce à la nouvelle liaison ferroviaire avec Amsterdamet l’intensification de l’agriculture et de l’horticulture en Frise occidentale. En plus de la culture des graines habituelles, les gens s’engagent de plus en plus dans la culture de graines de fleurs. La culture des pommes de terre et des légumes a augmenté continuellement et la culture des bulbes à fleurs offrait de bonnes perspectives. La fermeture du Zuiderzee en 1932 a fourni une vie raisonnable aux pêcheurs d’anguilles et de sandres. La population a augmenté rapidement après la Seconde Guerre mondiale et une ère de reprise a commencé. Diverses entreprises, grandes et petites, se sont développées. Les entreprises semencières actuellement implantées à Enkhuizen occupent une position de leader mondial. Une importante industrie du plastique est également implantée dans la municipalité. En termes de tourisme, Enkhuizen offre un magnifique centre-ville historique, le musée Zuiderzee et les marinas,