Pour la création de la mer des Wadden, nous devons remonter à environ 45 000 ans, jusqu’à la dernière période glaciaire. Toute l’eau de la mer du Nord était emprisonnée dans de grands glaciers, de sorte que le niveau de la mer était beaucoup plus bas qu’il ne l’est maintenant. Le littoral d’alors était à des dizaines de kilomètres au nord des îles Wadden actuelles. À la fin de la période glaciaire, les glaciers ont commencé à fondre et le niveau de la mer s’est élevé. Il y a environ 9 000 ans, la Manche s’est formée entre la France et l’Angleterre, et depuis lors, deux grands courants de crue se sont déversés dans la mer du Nord deux fois par jour , l’un du sud et l’autre du nord.
Il y a 6000 ans, le niveau de la mer n’était qu’à 5 mètres sous le niveau actuel. Les forces des deux courants de marée du sud et du nord ont créé une sorte d’effet bulldozer sur le sable de la mer du Nord . Une longue rangée de bancs de sable s’est formée, une soi-disant crête de plage. Au fil du temps, la crête de la plage a percé à divers endroits et la zone de tourbe derrière elle s’est remplie d’eau salée. Un vaste réseau de marais salants et de marécages et de grandes et petites îles a vu le jour. Une forte onde de tempête en 1362 a créé Dollard et le Zuiderzee. Même après 1362, la région a beaucoup changé; les îles sont devenues plus grandes ou plus petites, voire ont complètement disparu dans les vagues. Le Zuiderzee et le Lauwerszee ont été fermés et les zones de marais salants ont été récupérées sur la côte, ce que l’on appelle la remise en état des terres.