L’Afsluitdijk est principalement une défense contre les inondations, mais a diverses fonctions; de la gestion des risques d’inondation, l’approvisionnement en eau douce, l’écologie, la circulation et le transport par route et par eau jusqu’à l’histoire culturelle et les loisirs. Pour protéger la zone située derrière contre les inondations, la digue doit être suffisamment haute et solide pour résister à la mer dans les conditions les plus extrêmes. Les deux complexes d’écluses d’Afsluitdijk, le Stevinsluizen à Den Oever et les écluses Lorentz à Kornwerderzand, rejettent l’excès d’eau dans la mer des Wadden . Cette eau provient de l’ IJssel , une branche du Rhin originaire de Suisse et de l’ IJsselmeer.entre. Ces écluses sont utilisées par les navires professionnels et de plaisance pour se rendre dans la mer des Wadden et en revenir et sont très importantes en raison de l’accessibilité du nord, du centre et de l’est des Pays-Bas.

L’ IJsselmeer est une source importante d’eau douce pour les Pays-Bas. En période sèche, par exemple, l’eau destinée à l’agriculture peut être canalisée vers les zones environnantes, l’eau est utilisée comme eau potable et elle a des fonctions écologiques. C’est important pour de nombreuses espèces d’oiseaux et de poissons. L’Afsluitdijk s’est avéré être un obstacle imprenable pour les poissons qui migrent de l’eau douce vers l’eau salée, et vice versa. C’est pourquoi un passage pour poissons a été construit du côté ouest de l’écluse de Den Oever. En outre, une rivière de migration des poissons de 4 kilomètres de long est en cours de construction près de Kornwerderzand, qui traverse l’Afsluitdijk. Cette rivière garantit que le Waddenzee et l’ IJsselmeer sont à nouveau connectés et que les poissons peuvent facilement nager dans les deux sens.