El IJssel finalmente, presumiblemente a principios del siglo IV, se creó como un gran avance entre los dos sistemas de vías fluviales porque el estuario de Berkel, entre Arnhem y Doesburg y más tarde entre Arnhem y Zutphen, comenzó a contener más y más agua en los niveles altos de agua en el Rin . Para defender su frontera norte (‘limes’) los romanos empujaron en el cruce del Waaly el Neder-Rijn más agua al Neder-Rijn, lo que provocó que la inundación de agua atravesara la cuenca y las dunas del río y se dirigiera hacia el norte. Luego, pasaron varios siglos antes de que se formara un canal claro que también era navegable. Posteriormente, el curso del IJssel ha cambiado regularmente, también debido a la interferencia humana a través de canalizaciones, diques y pavimentos con espigones y bancos de piedra. La última canalización data de 1959, pero muy recientemente se cavó un desvío al Drontermeer al sur de Kampen. Actualmente, Rijkswaterstaat y el agua en nuevos canales secundarios para excavar el agua a un nivel muy alto para drenar más rápido en el IJsselmeer.