El Afsluitdijk es principalmente una defensa contra inundaciones, pero tiene varias funciones; desde la gestión del riesgo de inundaciones, el suministro de agua dulce, la ecología, el tráfico y el transporte por carretera y agua hasta la historia cultural y la recreación. Para proteger el área de atrás contra inundaciones, el dique debe ser lo suficientemente alto y fuerte para soportar el mar en las condiciones más extremas. Los dos complejos de esclusas en Afsluitdijk, Stevinsluizen en Den Oever y Lorentz en Kornwerderzand, descargan el exceso de agua al mar de Wadden . Esa agua proviene del IJssel , una rama del Rin que se origina en Suiza y del IJsselmeer.fluye en. Estas esclusas son utilizadas por embarcaciones profesionales y recreativas para ir y venir del Mar de Wadden y son muy importantes debido a la accesibilidad del norte, centro y este de los Países Bajos.

El IJsselmeer es un importante suministro de agua dulce para los Países Bajos. En períodos secos, por ejemplo, el agua para la agricultura se puede canalizar a los alrededores, el agua se utiliza como agua potable y tiene funciones ecológicas. Es importante para muchas especies de aves y peces. El Afsluitdijk resultó ser un obstáculo inexpugnable para los peces que migran del agua dulce al agua salada y viceversa. Es por eso que se ha construido un pasaje para peces en el lado oeste de la esclusa en Den Oever. Además, se está construyendo un río de migración de peces de 4 kilómetros de largo cerca de Kornwerderzand, que cruza el Afsluitdijk. Este río asegura que el Mar de Wadden y el IJsselmeer estén conectados nuevamente y que los peces puedan nadar fácilmente de un lado a otro.